Джейсон Борн живёт с Марией где-то на краю света, в Гоа, пытаясь восстановить душевное спокойствие и вспомнить то, что стёрлось из его памяти. Но это удаётся ему плохо, он каждый день записывает свои сны, тревожащие образами прошлого.
Однажды, возвращаясь с пробежки, он замечает незнакомую машину и подозрительного человека, который явно ищет кого-то. Профессиональный опыт сразу подсказывает ему, что это киллер, вычисливший его и приехавший убить. Быстро сориентировавшись, Борн забирает с пляжа Марию и пытается на джипе уйти от погони. Но в какой-то момент Марию настигает пуля киллера.
Борн приезжает в Неаполь под своим именем и сознательно даёт себя схватить. Но когда к нему приходит агент ЦРУ, Джейсон отключает его, чтобы скопировать симку из телефона. Когда ЦРУ-шник пришёл в себя, ему позвонили из штаб-квартиры. Из подслушанного разговора Борн узнаёт, что его обвиняют в убийстве двух человек в Берлине и краже каких-то документов.